Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms