Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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