Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkd2l2Q9JLG4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms