Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms