Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp12Q9D9M2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms