Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Alkbh4Q9D8F1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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