Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmed11Q9D2R4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms