Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms