Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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