Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed9Q99KF1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed9Q99KF1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed9Q99KF1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed9Q99KF1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed9Q99KF1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed9Q99KF1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed9Q99KF1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms