Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg5Q99J83 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms