Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Ddb2Q99J79 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ddb2Q99J79 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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