Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SbsnQ8CIT9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms