Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Bhlhe22Q8C6A8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms