Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms