Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms