Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ssxb10Q6XAR7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ssxb10Q6XAR7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ssxb10Q6XAR7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ssxb10Q6XAR7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ssxb10Q6XAR7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ssxb10Q6XAR7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ssxb10Q6XAR7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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