Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim28Q62318 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim28Q62318 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms