Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf123Q5XPI3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms