Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms