Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HmgcrQ01237 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms