Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2bQ01097 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms