Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms