Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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