Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Irx1P81068 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms