Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
NficP70255 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NficP70255 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NficP70255 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NficP70255 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NficP70255 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms