Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Csrnp3P59055 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Csrnp3P59055 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms