Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms