Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nedd1P33215 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms