Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VtnP29788 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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