Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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