Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms