Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms