Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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