Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20828J3KMI7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms