Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54bE9PXC0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Srp54bE9PXC0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Srp54bE9PXC0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Srp54bE9PXC0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Srp54bE9PXC0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Srp54bE9PXC0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54bE9PXC0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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