Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6880A3KG45 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms