Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ambra1A2AH22 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ambra1A2AH22 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms