Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk1bQ9Z2C6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upk1bQ9Z2C6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms