Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn8Q9Z260 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn8Q9Z260 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms