Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Ap3b1Q9Z1T1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms