Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms