Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syngr4Q9Z1L2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr4Q9Z1L2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr4Q9Z1L2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms