Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Padi1Q9Z185 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Padi1Q9Z185 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms