Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog1Q9Z160 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cog1Q9Z160 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cog1Q9Z160 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms