Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd97Q9Z0M6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd97Q9Z0M6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms