Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clip2Q9Z0H8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Clip2Q9Z0H8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clip2Q9Z0H8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clip2Q9Z0H8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms