Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ArcQ9WV31 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArcQ9WV31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ArcQ9WV31 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ArcQ9WV31 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms