Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf13bQ9WU72 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13bQ9WU72 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms