Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp18Q9WTV6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp18Q9WTV6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Usp18Q9WTV6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Usp18Q9WTV6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp18Q9WTV6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp18Q9WTV6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp18Q9WTV6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Usp18Q9WTV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp18Q9WTV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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